Wissenschaftlicher Mitarbeiter – Entwicklung, Anwendung und Evaluierung von Methoden der Hochdurchsatz-Metagenomik in cloudbasierten Ausführungsumgebungen (w/m/d)

Die Abteilung Computational Metagenomics am Institut für Bio- und Geowissen­schaften – Computer­gestützte Metagenomik (IBG-5) widmet sich bioinformatischen Forschungs­aktivitäten mit dem Fokus auf die inter­disziplinäre Entschlüsselung und Analyse von Metagenomen. Schwer­punkt ist insbesondere der Einsatz von Cloud-Technologien zur Analyse großer Daten­mengen und zur Unter­stützung verschiedener Anwendungen in den Lebens­wissen­schaften sowie der Biomedizin. Das IBG-5 integriert dabei sowohl auf nationaler (de.NBI) als auch auf inter­nationaler Ebene (ELIXIR) Service- und Infra­struktur­netzwerke, um solche Daten­analysen sowohl für die wissen­schaft­liche Gemein­schaft als auch für die Endanwender:innen effizienter und automatisierter zu gestalten.

Zur Unterstützung unserer Abteilung suchen wir zum nächst­möglichen Zeitpunkt einen

Wissenschaftlichen Mitarbeiter – Entwicklung, Anwendung und Evaluierung von Methoden der Hochdurchsatz-Metagenomik in cloudbasierten Ausführungsumgebungen (w/m/d)

Ihre Aufgaben:

• Arbeit an einem breiten Spektrum von Methoden und Anwendungen der Metagenomik und des Cloud-Computings
• Verarbeitung, Analyse und Interpretation von Metagenom­daten verschiedener NGS-Plattformen (u.a. Illumina, ONT, PacBio) im Rahmen verschiedener Kooperations­projekte
• Entwicklung von Analyse-Workflows unter Einbindung von Container- und Cloud-Technologien (z.B. Docker, Apptainer, S3, OpenStack, Ansible)
• Unterstützung der Abteilung im Bereich administrativer Projekt­arbeit, z.B. durch das Verfassen von Anträgen und Berichten und die Teil­nahme an Projekt­treffen
• Unterstützung der Abteilung bei der Planung und Durch­führung von Trainings­kursen für Wissen­schaftler:innen unter­schiedlicher Karriere­stufen und Fach­bereiche
• Veröffentlichung der wissenschaft­lichen Ergebnisse in inter­nationalen Fachzeit­schriften und Reisen zu Konferenzen
• Austausch mit internen und externen Projekt­partnern am IBG-5 und der Universität Bielefeld
• (Co-)Betreuung von Doktorand:innen

Ihr Profil:

• Ein abgeschlossenes wissenschaft­liches Hochschul­studium (Master) im Bereich der Bioinformatik, Informatik, Mathematik, Ingenieur-, Natur- oder Wirtschafts­wissen­schaften bzw. eines verwandten Studien­gangs mit anschließender abgeschlossener Promotion
• Erfahrung in Big-Data-Analysen in Verbindung mit Cloud-Technologien und Workflows
• Gute Kenntnisse in der Sequenz­analyse und Metagenomik, insbesondere bei der Verarbeitung von Illumina- und ONT-Daten
• Sehr gute Programmier­kenntnisse (z.B. in Python oder vergleichbar) und Kenntnisse in relevanten Technologien (z.B. Git, Docker, Nextflow)
• Sehr sicherer Umgang mit Linux / Unix
• Fließende Englischkenntnisse in Wort und Schrift
• Hohes Maß an Selbstständigkeit und Bereit­schaft, sich in komplexe Themen einzu­arbeiten
• Sehr zuverlässiger und gewissen­hafter Arbeitsstil
• Gute Publikationsleistung
• Bereitschaft zur aktiven Wissens­vermittlung, u.a. durch die Unter­stützung bei der Planung und Durchführung von Trainings­kursen
• Bereitschaft zu Reisen und zur Teilnahme an Konferenzen, Netzwerk­veranstaltungen und Projekt­treffen

Unser Angebot:

Wir arbeiten an hoch­aktuellen gesell­schaftlich relevanten Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzugestalten! Wir unter­stützen Sie in Ihrer Arbeit durch:

• Hochinteressante, interdisziplinär angelegte, abwechslungs­reiche Tätigkeit in einem hoch­aktuellen Themen­komplex
• Teilnahme an Projekttreffen und Konferenzen
• Starke Unterstützung und Mentoring für den Aufbau einer zukünftigen Karriere in der Wissen­schaft und/oder der Industrie
• Weiterentwicklung Ihrer persönlichen Stärken, z.B. durch ein umfang­reiches Trainings­angebot; ein strukturiertes Weiter­bildungs­programm und Vernetzungs­möglichkeiten speziell für Promovierende über JuDocS, das Jülicher Zentrum für Doktorand:innen und Betreuer:innen: https://www.fz-juelich.de/en/judocs
• Optimale Voraussetzungen zur Verein­barkeit von Beruf und Privatleben sowie eine familienbewusste Unter­nehmens­politik
• Die Möglichkeit zum (orts-)flexiblen Arbeiten, z.B. im Homeoffice, ist grund­sätzlich nach Abstimmung und im Einklang mit den anstehenden Aufgaben und (Vor-Ort-)Terminen gegeben
• Vermögenswirksame Leistungen und eine betrieb­liche Alters­vorsorge
• Flexible Arbeitszeitmodelle sowie eine Vollzeit­tätigkeit, die auch vollzeitnah ausgeübt werden kann
• 30 Tage Urlaub sowie alle Brückentage und zwischen Weihnachten und Neujahr immer dienstfrei

Wir bieten Ihnen eine spannende und abwechslungs­reiche Aufgabe in einem inter­nationalen und inter­disziplinären Arbeits­umfeld. Die Stelle ist auf zwei Jahre befristet mit der Möglich­keit einer länger­fristigen Perspektive. Vergütung und Sozial­leistungen erfolgen in Abhängig­keit von den vorhandenen Qualifikationen und je nach Aufgaben­übertragung im Bereich der Entgelt­gruppe 13 nach dem Tarif­vertrag für den öffent­lichen Dienst (TVöD-Bund).

Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir Ihnen noch viel mehr: https://go.fzj.de/Benefits.

Dienstort: Bielefeld

Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit viel­fältigen Hinter­gründen, z.B. hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancen­gerechtes, diverses und inklusives Arbeits­umfeld, in dem alle ihre Potenziale verwirk­lichen können, ist uns wichtig.

Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung bis zum 04.08.2024 über unser Online-Bewerbungsportal.

Fragen zur Ausschreibung?

Kontaktieren Sie uns gerne über unser Kontaktformular. Bitte beachten Sie, dass aus technischen Gründen keine Bewerbungen per E-Mail angenommen werden können.

Hilfreiche Informationen zum Bewerbungs- und Auswahl­prozess finden Sie hier. Zudem finden Sie Antworten auf häufig gestellte Fragen bei unseren FAQs.

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